这是一个忍者的世界，从小身上封印着邪恶的九尾妖狐的鸣人,受尽了村人的冷落，只是拼命用各种恶作剧试图吸引大家的注意力。同时他又是勤奋和乐观的为了得到大家的认可，为了成为火影努力修行。在《忍者风暴》玩家也许可以助鸣人一臂之力，与他一路同行成就共同的梦想。
在忍者世界必须有一个忍者身份，就必须选择一个自己修行的流派，在《忍者风暴》依据动漫的元素共设置了三个流派，分别为秘术流、忍术流、以及体术流，不同的流派都拥有两个不同性别的人物。玩家可以根据自己的喜好，选择相对应的流派和角色。
